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        基因組/代謝組學
        全基因組DNA甲基化測序

        時間:2020-07-21 15:11:00 瀏覽:2102次


        全基因組Bisulfite(Whole-genome bisulfite sequencing,WGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina HiSeq高通量測序平臺相結合,進行全基因組范圍內的精確甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率,精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態,從而構建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。

        技術路線

        案例分析

        案 例伯基特淋巴瘤和濾泡淋巴瘤的全基因組甲基化分析揭示與體細胞突變及轉錄調控相關的甲基化差異區域

        對伯基特、濾泡淋巴瘤細胞及正常生發中心B細胞進行WGBS,與正常B細胞相比,淋巴瘤全基因組處于低甲基化水平,但是在 CpGs島嶼的甲基化水平比正常B細胞高;另外兩種淋巴瘤之間的甲基化水平也存在差異,且在潛在啟動子區域,隨著基因表達的增強,甲基化水平也有一定的增加。

        參考文獻

        Kretzmer H, Bernhart S H, Wang W, et al. DNA methylome analysis in Burkitt and follicular lymphomas identifies differentially methylated regions linked to somatic mutation and transcriptional control[J]. Nature genetics, 2015, 47(11): 1316-1325.

        威斯騰生物服務項目


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        實時熒光定量PCR 單克隆抗體制備 帕金森疾病模型
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