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        基因/蛋白芯片
        lncRNA芯片

        時間:2020-07-20 14:40:00 瀏覽:1958次


        一、lncRNA芯片

        長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA) 指的是長度在200-100000 nt之間的RNA分子,它們不編碼蛋白,但參與細胞內多種過程調控。人們對lncRNA的認識還處在初級階段,lncRNA起初被認為是基因組轉錄的“噪音”,是RNA聚合酶II轉錄的副產物,不具有生物學功能。然而,近年來的研究表明,lncRNA參與了X染色體沉默、基因組印記以及染色質修飾、轉錄激活、轉錄干擾、核內運輸等多種重要的調控過程,與人類疾病的發生、發展和防治都有著密切的關系。lncRNA的種類遠遠超過編碼RNA,哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產生的轉錄本是lncRNA(相應的蛋白編碼RNA的比例是1%-5%)。lncRNA已經成為非編碼RNA研究領域的一個熱點。
        lncRNA研究的重要一步是發現與特定疾病相關的lncRNA。傳統的lncRNA篩選方法(SELEX等)效率低下,假陽性率高。而基因芯片具有覆蓋全面、高效、準確的特點,因此用基因芯片來篩選lncRNA是一種準確快捷的方法。

        二、lncRNA技術特點:
        1)目前市面上探針密度最高的lncRNA芯片產品;
        2)芯片采用Agilent eArray平臺設計,使用Agilent SurePrint技術合成,技術重復性高于99%;
        3)覆蓋主流數據庫所有lncRNA,可同時檢測lncRNA和mRNA,并挖掘兩者之間的關聯;
        4)檢出率高:隨機引物擴增方式,可同時擴增帶Ploy-A和不帶Poly-A的lncRNA,確保更多的 lncRNA被檢測出來;
        5)提供完整lncRNA芯片數據分析解決方案。

        三、lncRNA芯片服務流程:

        1、總RNA提??;

        2、反轉錄合成cDNA;

        3、體外轉錄合成cRNA;

        4、隨機引物合成正義鏈cDNA

        5、DNA片段化,生物素標記;

        6、芯片雜交、洗滌、染色、掃描。

        四、樣本要求:細胞、新鮮組織或總RNA樣品

        1、提取RNA量≥1ug;

        2、細胞樣品或新鮮組織塊(切成~50mg的小塊)直接液氮凍存后,-80℃保存。

        3、樣品運輸:細胞或者組織樣品;或者總RNA樣本置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰運輸。

        五、應用:

        篩選差異表達的lncRNA和mRNA、lncRNA功能注釋、lncRNA調控機制預測

        六、服務流程



        七、服務項目


        分子生物學類 蛋白質與免疫學 動物實驗
        實時熒光定量PCR 單克隆抗體制備 帕金森疾病模型
        免疫共沉淀(Co-IP) 多克隆抗體制備 抑郁癥動物模型
        ELISA(酶聯免疫吸附法)技術 Western-blot 實驗服務 脊髓損傷模型
        生化指標檢測 蛋白雙向電泳實驗服務 腦外損傷模型
        雙熒光素酶報告基因檢測 原核蛋白表達純化 骨神經損傷模型
        染色質免疫共沉淀(ChIP) 真核蛋白表達純化 心肌缺血模型
        GST pull Down ITRAQ定量蛋白質組學 心力衰竭模型
        SLAC蛋白組學 肺動脈高血壓動物模型
        高血壓模型
        病毒類 實驗課題整體外包 粥樣動脈硬化模型
        過表達/干擾慢病毒包裝純化 整體課題外包 大腦中動脈阻塞模型
        過表達/干擾腺病毒包裝純化 細胞整體實驗外包 慢性之氣管炎模型
        逆轉錄病毒包裝純化 動物整體實驗外包 過敏性哮喘模型
        腺相關病毒包裝純化 肺炎大鼠模型
        肝炎-肝硬化-肝癌模型
        蛋白芯片 原代細胞培養 肝纖維化模型
        細胞因子芯片 骨髓間充質干細胞培養 膽結石模型
        生長因子芯片 脂肪干細胞培養 急性胰腺炎模型
        信號通路磷酸化水平檢測芯片 心肌成纖維細胞培養 急性腎衰竭模型
        BioPlex懸浮芯片 軟骨細胞培養 體內血栓模型
        生長因子芯片 血管內皮細胞培養 關節炎模型
        炎癥因子芯片 神經元細胞培養 I型和II型糖尿病模型
        血管生成因子芯片 內皮組細胞原代培養 裸鼠成瘤
        凋亡因子芯片 基因編輯動物
        趨化因子芯片 電生理相關服務 動物整體實驗服務
        HuProt TM 20K人類蛋白組芯片 膜片鉗實驗
        細胞生物學 高通量測序 代謝組學
        細胞原代培養 mRNA測序 氣相色譜GC/MS
        MTT檢測 LncRNA測序 液相色譜LC/MS
        細胞凋亡檢測 全基因組測序 核磁共震NMR
        細胞周期檢測 RNA-Seq測序
        細胞克隆形成實驗 外顯子測序 影像學相關實驗
        Transwell細胞遷移/侵襲 16s擴增子測序 Micro-CT
        流式分選 Small RNA測序 小動物活體成像
        CCK8/XTT檢測 宏基因組測序 核磁共振
        臺盼藍檢測細胞活性 單細胞測序 PET-CT
        藥物篩選細胞學實驗 circleRNA測序
        細胞粘附性檢測 甲基化測序 基因編輯動物
        細胞劃痕實驗 條件性敲除小鼠/大鼠
        細胞生物學整體實驗 全基因敲除小鼠/大鼠
        細胞成管實驗
        病理類 CRISPR/Cas9細胞敲除/敲入 基因芯片
        掃描電鏡 基因定點突變細胞系 LncRNA芯片
        透射電鏡 單基因敲除細胞系 miRNA芯片
        HE染色 多基因敲除細胞系 mRNA芯片
        免疫組化 目的基因敲入細胞系 甲基化芯片(限人和小鼠來源樣本)
        Tunel(原位末端凋亡法)檢測 報告基因敲入細胞系 SNP芯片(限人和小鼠來源樣本)
        激光共聚焦 miRNA/LncRNA敲除細胞系
        免疫熒光
        Masson染色 CRISPR/Cas9動物敲除/敲入
        原位雜交 基因敲除大鼠/小鼠
        熒光原位雜交 基因敲入大鼠/小鼠
        特殊染色(PSA、茜素紅、阿爾新藍等)
        行為學檢測 藥物篩選服務項目 藥效學評價
        水迷宮實驗 高通量自動藥物篩選平臺 神經系統藥物藥效學評價
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        Agilent miRNA芯片服務


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